„Антропоид“ је заснован на невероватној истинитој причи о операцији Антропоид, што је било шифровано име за мисију чехословачких оперативаца чији је циљ био убиство СС официра Рајнхарда Хајдриха. Хајдрих, главни архитекта Коначног решења, био је трећи у ланцу команде, одмах иза Хитлера и Химлера и вођа нацистичких снага у Чехословачкој. Филм прати двојицу војника из чехословачке војске у егзилу, Јозефа Габчика (Килијан Марфи) и Јана Кубиша (Џејми Дорнан), који су се спустили падобраном у своју окупирану домовину у децембру 1941. године. Уз ограничене обавештајне податке и недовољно опреме у граду под изолацијом, морају да нађу начин да убију Хајдриха, у операцији која ће заувек изменити лице Европе.