I Digiprescelti, sconvolti dalle rivelazioni sull'Imperatore Digimon, cercano Ken per parlargli, tuttavia il ragazzo pare scomparso. Ken si trova infatti a Digiworld, dove ha deciso di trasferirsi definitivamente, e ha riconquistato parecchi settori. Inoltre rapisce Greymon e gli mette l'Anello del Male. I Digiprescelti tornano a Digiworld per combattere l'Imperatore, che cerca di far digievolvere Greymon in MetalGreymon, ma il Digimon, dominato dalle forze del male, digievolve SkullGreymon e si rivolta contro l'Imperatore. SkullGreymon, sfinito, ritorna Agumon e viene rapito nuovamente dall'Imperatore, che conquista così numerosi settori che erano sotto la protezione di Greymon.