Malgré son statut de pilote d'Evangelion, Shinji reste soumis à ses obligations scolaire. Lors de son arrivée en classe, il rencontre Kensuke Aida et Toji Suzuhara. Kensuke est un véritable « military otaku » dont le rêve est de devenir pilote. Caméra à la main, il est toujours à l'affût de la moindre opération militaire dans Tokyo-3. Toji est un garçon taciturne qui n'a que sa sœur pour toute famille. Celle-ci a été blessée durant l'attaque du Troisième Ange. Toji nourrit une rancœur féroce à l'égard du pilote de l'Eva qu'il tient pour responsable. Lorsqu'il apprend qu'il s'agissait de Shinji, il décide de se venger.